优化创新环境，鼓励自主创新，在“我为《政府工作报告》建言献策活动”中，很多市民纷纷就这一话题进言。市科技局对此类问题进行了梳理分类，落实责任单位，各司其职推进创新型城市建设。
针对市民提出的“优化创新环境，重奖自主创新”的建议，市科技局回复，“筹备召开全市科技进步表彰暨创新型城市建设大会，进一步完善和落实关于增强自主创新能力、建设创新型城市的若干政策。在3年来已累计对自主创新奖励1.6亿元的基础上，再拿出5000万元左右的资金，重点奖励2009年度在企业研发机构建设及实施名牌、商标、标准、专利战略中作出突出贡献的单位和个人。”
有市民建议，“引导企业研发投入，鼓励企业技术创新”。市科技局就具体措施给予答复：投入1/3左右的市级应用技术研究开发经费，组织实施好济南市高新技术产业化重大科技专项。同时，积极争取省和国家的科技项目、资金支持，引导带动企业加大科技投入；积极组织企业建设各级各类工程技术中心、实验室、产学研基地、博士后工作站等，建设技术创新研发平台，引导企业加大对科技和人才的投入；认真落实企业研发投入和高新技术企业认定等相关税收优惠政策，鼓励企业积极加大科技投入等。
还有市民建议，“发挥省城优势，加快发展高新技术产业”。对此，市科技局答复说，已经制定如下推进措施：一是优先发展战略性新兴产业。从2010年开始，集聚各类创新资源，实施高新技术产业化重大专项，大力推进电子信息、生物医药、新能源、新材料“四大产业”和北车风电产业园、鲁能电工电器产业园、力诺光电产业园、晟朗太阳能产业园、华光光电子产业园、富士康LED产业园、国家信息通信国际创新园等“七大园区”建设发展；二是加快促进中小型科技企业快速发展，重点使用好中小企业创新基金，落实好高新技术企业税收优惠等政策，加大对中小型成长型企业的科技创新扶持力度；三是深入实施制造业信息化，充分运用高新技术嫁接改造传统产业，加快传统优势产业高新化步伐；四是充分发挥省会高校院所科技资源优势，加快科技成果向济南落地转化，重点在2010年组织举办好第5届信博会和第6届科交会，搭建高层次产学研合作创新平台。再建2至3个行业、产业技术创新联盟，整合创新资源，实施集成创新，加快技术在行业内转移转化。
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